小麥miR166基因家族鑒定及表達分析

雷曉彤; 徐渴; 孫若希; 張樹華; 楊學舉; 趙勇

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小麥miR166基因家族鑒定及表達分析

首發時間：2023-04-07

雷曉彤 ¹
雷曉彤（1999-），女，在讀碩士研究生
徐渴 ¹ 孫若希 ¹ 張樹華 ¹ 楊學舉 ¹ 趙勇 ¹
趙勇（1984-），男，博士生導師，主要研究方向：小麥重要性狀基因的挖掘與功能研究；

1、河北農業大學農學院，華北作物改良與調控國家重點實驗室，華北作物種質資源研究與利用教育部重點實驗室，保定 071000

摘要：miR166在植物生長發育和對環境脅迫的反應中具有重要作用。利用PmiREN、EnsemblPlants數據庫、MEGA-X、DNAMAN軟件以及RNAfold web server、WebLogo和psRNATarget在線網站對小麥miR166（Tae-miR166）基因家族的進化特性和表達模式進行分析，對Tae-miR166基因家族進行研究。在PmiREN數據庫中搜索到19個Tae-miR166基因家族成員，染色體定位發現Tae-miR166成員定位于14條染色體上。序列比對發現Tae-miR166的成熟體序列高度保守；進化分析結果表明，Tae-miR166基因家族成員分別處于4個進化分支。靶基因預測結果表明Tae-miR166的靶基因包括Ⅲ類同源異型結構域亮氨酸拉鏈蛋白、β半乳糖苷酶和鈣依賴性蛋白激酶等。轉錄組數據分析表明Tae-miR166家族19個成員在小麥6個組織中都有表達,在籽粒和穗中表達量最高。熒光定量PCR結果表明，Tae-miR166家族成員在鎘、干旱和低溫脅迫處理后的表達模式存在差異,說明Tae-miR166家族基因在植株抵御非生物脅迫時發揮著重要作用。本研究為進一步闡明Tae-miR166家族基因的功能提供了理論依據。

關鍵詞：小麥 Tae-miR166 進化規律靶基因

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Genome-wide identification and expression analysis of miR166 gene family in Triticum aestivum L.

LEI Xiaotong ¹
雷曉彤（1999-），女，在讀碩士研究生
XU Ke ¹ SUN Ruoxi ¹ ZHANG Shuhua ¹ YANG Xueju ¹ ZHAO Yong ¹
趙勇（1984-），男，博士生導師，主要研究方向：小麥重要性狀基因的挖掘與功能研究；

1、North China Key Laboratory for Crop Germplasm Resources of Education Ministry, State Key Laboratory of North China Crop Improvement and Regulation, College of Agronomy, Hebei Agricultural University, Baoding 071000

Abstract：miR166 has an essential role in plant growth and development and in response to environmental stresses. The evolutionary characteristics and expression patterns of miR166 gene family in wheat (Tae-miR166) were analyzed by PmiREN, Ensembl Plants database, MEGA-X, DNAMAN software, RNAfold web server, WebLogo and psRNATarget online websites. Nineteen members of the Tae-miR166 gene family were searched in the PmiREN database, and chromosome localization revealed that Tae-miR166 were localized on 14 chromosomes. Sequence alignment revealed that the mature sequences of Tae-miR166 were highly conserved; evolutionary analysis showed that the Tae-miR166 gene family members were in four evolutionary branches, respectively. The target gene prediction results showed that the target genes of Tae-miR166 gene family included class III homologous heterotypic structural domain leucine zipper protein, beta-galactosidase and calcium-dependent protein kinase. RNA-seq data analysis showed that 19 members of the Tae-miR166 family were expressed in 6 tissues of wheat, with the highest expression in grains and ears. The results of RT-qPCR showed that the expression patterns of Tae-miR166 family members were different after cadmium, drought and low temperature stress treatment, indicating that Tae-miR166 family genes played an important role in plant resistance to abiotic stress.This study provided a theoretical basis for further elucidating the function of miR166 family genes in wheat.

Keywords： wheat Tae-miR166 evolutionary law target gene

基金：

1. 河北省自然科學基金項目（C2021204066）

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雷曉彤，徐渴，孫若希，等. 小麥miR166基因家族鑒定及表達分析[EB/OL]. 北京：中國科技論文在線 [2023-04-07]. http://www.cielomedsolutions.com/releasepaper/content/202304-99.

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論文編號	202304-99
論文題目	小麥miR166基因家族鑒定及表達分析
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